Il comune di Santo Stefano Lodigiano è ubicato alla sinistra del Po, nella zona più meridionale della pianura lodigiana, lungo la linea ferroviaria Piacenza-Milano.

L'abitato conserva un'impronta tipicamente rurale, con le sue case basse, allineate lungo la via principale. L'economia si basa sull'agricoltura pur essendo presenti anche piccole attività artigianali.